Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	16962	17047	86	50 [0]	[0] 35	mokC/nhaA	regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter

GCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAA  >  W3110S.gb/17048‑17109 |                                                              gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTAt                  >  1:307813/1‑46 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:848189/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:46102/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:527432/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:545881/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:59094/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:668214/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:743912/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:818317/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:418829/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:871045/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:895761/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:909001/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:982645/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:985733/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:985789/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:995383/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1244995/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1079259/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1096197/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1126592/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1139267/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1204934/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1219538/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1230927/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1051983/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1258149/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:1350514/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:263712/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:273172/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:276952/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:396592/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGA‑TCTAATCCTGaa  >  1:953030/1‑61 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACACATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGaa  >  1:536933/1‑62 (MQ=255) gCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAAACCATTTTTTTTTAt                  >  1:168279/1‑46 (MQ=255) |                                                              GCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAA  >  W3110S.gb/17048‑17109

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑