Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4177816	4177886	71	65 [0]	[0] 50	gspJ	predicted general secretory pathway component, cryptic

AGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGATTTCTTT  >  W3110S.gb/4177887‑4177948 |                                                              aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTg                       >  1:910361/1‑41 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAAc                >  1:1090904/1‑48 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:283649/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:983635/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:384981/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:389039/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:416553/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:425881/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:438210/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:470777/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:567382/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:587673/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:589064/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:649671/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:672911/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:725208/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:753471/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:79591/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:869787/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:881893/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:90460/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:963009/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:966239/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1078208/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1420209/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1124234/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1142626/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:116607/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1198533/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1251898/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:126537/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1391538/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1414817/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:274000/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1439272/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:143980/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1443790/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1448473/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:1471346/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:161806/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:177887/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:182984/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:20344/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:213262/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:22581/1‑62 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttctt   >  1:1311125/1‑61 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttctt   >  1:811050/1‑61 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttctt   >  1:4203/1‑61 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttctt   >  1:1154359/1‑61 (MQ=255) aGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCAGTAGCTGATTGAACTGCTGGAtttcttt  >  1:700401/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGGAGATCGTTATCAAGAATGGTGATGGTGCGCTGTAGCTGATTGAACTGCTGGATTTCTTT  >  W3110S.gb/4177887‑4177948

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑