Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4280917	4280995	79	58 [0]	[0] 31	[soxS]	[soxS]

TTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGA  >  W3110S.gb/4280996‑4281057 |                                                              ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCg   >  1:1179583/1‑61 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:323959/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:993511/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:976394/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:950465/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:927245/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:924090/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:849643/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:726822/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:657309/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:630495/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:579195/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:530526/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:497517/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:464003/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:410863/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:389498/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:286649/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:266405/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:221672/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:210707/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:169756/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:152902/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1388952/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1356068/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1265392/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1192245/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1129421/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:1088907/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGa  >  1:102528/1‑62 (MQ=255) ttCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTT‑AGGTAAAGCGa  >  1:1015966/1‑61 (MQ=255) |                                                              TTCAGTTCGTTAATTCATCTGTTGGGGAGTATAATTCCTCAAGTTAACTTGAGGTAAAGCGA  >  W3110S.gb/4280996‑4281057

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑