Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4550175	4550299	125	39 [0]	[0] 28	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

CCTGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATA  >  W3110S.gb/4550300‑4550360 |                                                             cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCTGAAATa  <  1:169137/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:384995/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:921886/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:862569/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:809821/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:788186/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:762088/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:595708/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:562265/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:541676/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:524497/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:492944/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:473793/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:466946/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:39610/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1211412/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:360710/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:302290/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:285104/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:223039/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:206262/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:175025/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1430903/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1408214/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1292995/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1279203/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1274922/61‑1 (MQ=255) cctGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATa  <  1:1257479/61‑1 (MQ=255) |                                                             CCTGAGTTATGGGATCCCGGTATTAATGCCGGATTGCTCAATTATAATTTCAGCGGAAATA  >  W3110S.gb/4550300‑4550360

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑