Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2006425	2006555	131	35 [0]	[0] 7	fliD	flagellar filament capping protein

ATGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGT  >  W3110S.gb/2006556‑2006617 |                                                              aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:1282960/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:1319490/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:177790/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:609498/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:621648/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:733074/1‑62 (MQ=255) aTGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGt  >  1:915465/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATGACACCGGCCTTGATAATGCGATGACACTCTCGGTCAGCGGTGATGATGCGCTACAAAGT  >  W3110S.gb/2006556‑2006617

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑