Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2020053	2020195	143	42 [0]	[1] 67	[fliI]–[fliJ]	[fliI],[fliJ]

AGCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTG  >  W3110S.gb/2020195‑2020257  |                                                              aGCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAA‑AACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:935623/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:43577/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:661041/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:560495/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:532210/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:471306/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:470629/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:448311/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:446657/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:439483/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:700988/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:42062/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:417595/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:408384/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:366910/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:358371/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:339586/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:69905/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:293979/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:706188/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:731644/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:740275/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:746938/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:760513/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:767972/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:76969/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:787573/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:809788/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:839186/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:839878/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:913631/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:954972/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:962384/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1138254/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1331652/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1327544/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1323552/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1307900/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1260893/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:12155/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1196071/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1168293/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1404246/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1134000/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1123451/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1114276/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1107334/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1089026/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1074882/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1014972/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:142997/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:292486/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:291338/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:289640/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:263515/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:223426/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:215257/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:206484/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:192568/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:191191/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:173256/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:163308/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:154447/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1453191/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1431387/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:1012368/62‑1 (MQ=255)  gCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATAACGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTg  <  1:295561/62‑1 (MQ=255)  |                                                              AGCTCAAAATGCTGATTGATTATCAGAATGAATATCGCAATAACCTCAACAGCGATATGAGTG  >  W3110S.gb/2020195‑2020257

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑