Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2075868	2075877	10	58 [0]	[0] 48	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

ACCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCA  >  W3110S.gb/2075878‑2075939 |                                                              aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCTGTCATCTCGGTCa  <  1:1458915/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:400182/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:208905/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:214235/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:271345/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:296430/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:31309/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:316833/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:352039/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:369939/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:376238/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:399522/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1451973/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:527405/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:537093/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:770942/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:771257/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:777364/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:845170/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:887043/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:983486/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:985138/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:986593/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:988793/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1251269/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1034457/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1050928/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1061568/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1080521/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1083622/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1088484/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1102544/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:111210/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1157220/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1162472/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1187485/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1001537/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1261720/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1277077/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1309240/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1315319/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1317852/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1341576/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1384229/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1389672/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1398447/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1429294/62‑1 (MQ=255) aCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:143076/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCA  >  W3110S.gb/2075878‑2075939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑