Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2075883	2075901	19	21 [0]	[0] 43	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

ATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCGG  >  W3110S.gb/2075821‑2075882                                                              | aTGCTGACACAGGCAATGGACTATTACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2223696/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2596705/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:963606/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:941416/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:841511/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:396543/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:378894/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2845110/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2842029/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2631131/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2618836/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1036602/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:2528864/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1877488/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1508680/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1434411/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1101160/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1097647/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1075745/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:1068859/1‑62 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGCACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCgg  >  1:568416/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCGG  >  W3110S.gb/2075821‑2075882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑