Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2075883	2075901	19	21 [0]	[0] 43	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

AGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCA  >  W3110S.gb/2075902‑2075939 |                                      aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:543627/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1028627/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2160292/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:240849/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2531407/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2826548/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2833762/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:326642/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:445342/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:448096/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:480403/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2134343/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:58154/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:633198/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:65254/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:693574/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:763729/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:76608/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:866547/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:91602/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:985646/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1684795/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1042386/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1077558/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1085418/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1093155/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1225983/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1233664/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1609828/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1629917/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1630480/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:2042264/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1709260/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:177660/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1816446/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1842997/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1850387/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1871181/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1904721/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1963303/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa  <  1:1995675/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCAGTCa  <  1:2859797/38‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGCTCAGCATTCAGGGCGGTCAGCTCGGTCa  <  1:908335/38‑1 (MQ=37) |                                      AGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCA  >  W3110S.gb/2075902‑2075939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑