Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3308342	3308366	25	40 [0]	[0] 6	nlpI	conserved hypothetical protein

TCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACTT  >  W3110S.gb/3308304‑3308341                                      | tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTATCtt  >  1:1768287/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:623786/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2700758/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2748853/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2785338/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2829872/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:463285/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:479905/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:501440/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:526483/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:550634/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2700100/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:630630/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:646839/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:671073/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:689198/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:762161/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:769276/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:782984/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:946081/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:227148/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:155725/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1558913/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1608109/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1616210/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1761432/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1783462/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1862699/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1865823/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2174042/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:1034241/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2329571/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2392037/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2430789/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2456699/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2457128/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2566778/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2623558/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:2627422/1‑38 (MQ=255) tCTTGATAAAACGCCAGCACATCATCTTGCGCTAACtt  >  1:391470/1‑38 (MQ=255)                                      | TCTTGATAAAACGCCAGCAGATCATCTTGCGCTAACTT  >  W3110S.gb/3308304‑3308341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑