Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3347937	3347941	5	20 [0]	[0] 30	npr	phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of N‑regulated PTS system (Npr)

CCTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGA  >  W3110S.gb/3347875‑3347936                                                               | ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:1221069/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:870897/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:1823502/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2095693/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2101328/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:225667/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2273180/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2417301/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:522239/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2636426/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:399121/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2811513/62‑1 (MQ=255) ccTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:391124/62‑1 (MQ=255)  cTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGCAAGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:732094/62‑1 (MQ=255)  cTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:1345336/61‑1 (MQ=255)  cTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2453185/61‑1 (MQ=255)  cTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:1887704/61‑1 (MQ=255)  cTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:157005/61‑1 (MQ=255)   tGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:2776952/60‑1 (MQ=255)               gTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGa  <  1:871364/48‑1 (MQ=255)                                                               | CCTGCAATGAAGCTGTTTGAATTAATGC‑AGGGTTTTGACGCTGAAGTGCTCTTACGTAATGA  >  W3110S.gb/3347875‑3347936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑