Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3843138	3843157	20	20 [0]	[0] 5	rfaL	O‑antigen ligase

TTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATATT  >  W3110S.gb/3843078‑3843137                                                            | tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAGTATAAATAtt  <  1:1655407/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:944189/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:1098208/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:864533/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:700442/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:551356/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:494424/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2841284/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2816796/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2774805/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2669557/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2363587/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:228029/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2265520/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2197843/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2098037/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:1905288/60‑1 (MQ=255) tttGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:1886687/60‑1 (MQ=255) tttGATTTAAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATAtt  <  1:2674288/60‑1 (MQ=255)               gCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATTTAAATAtt  <  1:442396/46‑1 (MQ=255)                                                            | TTTGATTTTAGCTGGCTAGTTAGTGTCAAGAAAACAATAAAAGAACCAAATATAAATATT  >  W3110S.gb/3843078‑3843137

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑