Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3843138	3843157	20	20 [0]	[0] 5	rfaL	O‑antigen ligase

ATGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATCAA  >  W3110S.gb/3843158‑3843219 |                                                              aTGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATcaa  <  1:1086548/62‑1 (MQ=255) aTGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATcaa  <  1:2691926/62‑1 (MQ=255) aTGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATcaa  <  1:2808004/62‑1 (MQ=255) aTGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATcaa  <  1:586167/62‑1 (MQ=255) aTGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATcaa  <  1:832686/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATGGTAAGTAGCACGAAATGGCGAATTATCTACTTTAAACGCAGAATACCAAATTAAATCAA  >  W3110S.gb/3843158‑3843219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑