Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	294950	294960	11	25 [0]	[0] 34	intF	predicted phage integrase

ATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGT  >  W3110S.gb/294889‑294949                                                             | atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:2591846/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:816670/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:783941/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:764517/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:715155/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:698505/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:61004/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:483178/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:46985/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:410243/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:349487/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:346027/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:2634553/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1152615/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:2530054/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:2523689/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:2115061/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:189392/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1664398/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1585876/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1562615/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1374763/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1364804/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1233449/1‑61 (MQ=255) atatTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGt  >  1:1168460/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGT  >  W3110S.gb/294889‑294949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑