Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1134213	1134228	16	28 [0]	[0] 19	flgE	flagellar hook protein

ATGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTGG  >  W3110S.gb/1134151‑1134212                                                              | aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2498482/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:975855/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:962787/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:876173/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:765771/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:753709/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:689343/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:628792/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:603351/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2888579/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:280793/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2793879/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2594726/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2512316/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1217262/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2336548/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2224079/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2179364/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2067127/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:2014959/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1902474/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1779491/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1731082/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1424823/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1377782/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1292186/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1260466/62‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTgg  <  1:1236048/62‑1 (MQ=255)                                                              | ATGGCCTTTTCTCAAGCGGTTAGCGGATTAAACGCTGCCGCCACCAACCTCGATGTTATTGG  >  W3110S.gb/1134151‑1134212

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑