Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1247498	1247584	87	16 [0]	[0] 46	treA	periplasmic trehalase

CCCCGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGGTGT  >  W3110S.gb/1247436‑1247497                                                              | ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:1222695/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:1686946/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:1730530/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:194153/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2103113/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2199162/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2230923/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2328912/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2534615/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2576111/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2872091/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:297141/62‑1 (MQ=255) ccccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:602828/62‑1 (MQ=255)  cccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2761937/61‑1 (MQ=255)  cccGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:300693/61‑1 (MQ=255)        ccGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGgtgt  <  1:2517374/55‑1 (MQ=255)                                                              | CCCCGTTCCGGTGGTGCTGACATCATATTTTTCCACCAGCTTTTTCTCCCGGTCATAGGTGT  >  W3110S.gb/1247436‑1247497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑