Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1414121	1414123	3	22 [0]	[0] 16	intR	integrase

CTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCA  >  W3110S.gb/1414060‑1414120                                                             | cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1107746/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:904726/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:701408/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:507351/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:290682/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:2582635/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:2523610/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:2479345/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:2296126/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:222635/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1895096/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1790491/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1589786/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:145440/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1405778/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1158777/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1109422/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:1028816/61‑1 (MQ=255) cTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTCCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:758482/61‑1 (MQ=255)  ttttGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:2163021/60‑1 (MQ=255)  ttttGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:6843/60‑1 (MQ=255)                    tCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCa  <  1:222653/42‑1 (MQ=255)                                                             | CTTTTGCGATGATGCCCGGTCAGTTTGTATTGCTCCTTCAGTGCTTCAAGAGCAGGCTGCA  >  W3110S.gb/1414060‑1414120

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑