Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1433237	1433240	4	22 [0]	[0] 25	stfR	predicted tail fiber protein

GATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGC  >  W3110S.gb/1433175‑1433236                                                              | gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2204687/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:882399/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:880989/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:740544/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:623483/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2874979/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2861017/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2609932/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2379776/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2289781/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:110607/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2204088/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2029967/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1912110/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1845036/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1782354/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1595025/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1481050/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1467532/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1339725/62‑1 (MQ=255) gATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:1256394/62‑1 (MQ=255)        cTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGc  <  1:2582449/55‑1 (MQ=255)                                                              | GATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGC  >  W3110S.gb/1433175‑1433236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑