Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1701575	1701601	27	23 [0]	[0] 22	malX	fused maltose and glucose‑specific PTS enzyme IIBC components

CTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCG  >  W3110S.gb/1701513‑1701574                                                              | cTCGGTGCGGTGCTCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2872632/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:221582/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:859719/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:847857/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:51672/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2864864/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:26729/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2631578/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2618086/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2558937/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2328233/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:231779/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2196682/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2011440/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:16475/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1636965/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1361249/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1299304/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1274109/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1208591/62‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGGGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1115286/62‑1 (MQ=255)  tCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:2033802/61‑1 (MQ=255)   cggtgcggtgATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg  <  1:1302671/60‑1 (MQ=255)                                                              | CTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCG  >  W3110S.gb/1701513‑1701574

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑