Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1701575	1701601	27	23 [0]	[0] 22	malX	fused maltose and glucose‑specific PTS enzyme IIBC components

CGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATT  >  W3110S.gb/1701602‑1701662 |                                                             cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTTGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1589756/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2174938/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:991678/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:655905/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:423735/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:392380/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2861145/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2716524/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2709791/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2534778/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:229197/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2226958/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1287442/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2091980/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2082447/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2080797/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:2035948/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1921770/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1796147/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1595451/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:1516369/61‑1 (MQ=255) cggTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt  <  1:133572/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATT  >  W3110S.gb/1701602‑1701662

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑