Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2015031	2015042	12	29 [0]	[0] 10	fliE	flagellar basal‑body component

GCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTA  >  W3110S.gb/2015043‑2015104 |                                                              gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:1323041/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:1705947/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:1906508/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:2343775/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:2549003/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:527815/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:684498/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:825072/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATCCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:1591296/62‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAACTAATGGTCGGGTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTa  <  1:2568081/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCCGGCAAAACTAATGGTCGGTTGCGGCAGTGATTCCTGCGCACGCGCACTCATCGCCGTA  >  W3110S.gb/2015043‑2015104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑