Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4538639	4538681	43	30 [0]	[0] 51	yjhX	conserved hypothetical protein

TCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGA  >  W3110S.gb/4538682‑4538743 |                                                              tCTACCTTTAGCGATAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2173540/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2894822/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2090688/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:211668/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2152251/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2350441/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2351584/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:240596/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2439022/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:246492/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2493717/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2629002/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2701575/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2056885/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:343233/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:350612/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:402063/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:523639/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:605181/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:81751/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:869350/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:883540/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:936795/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:951191/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:975809/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1996602/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1067613/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1098639/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1135651/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1185835/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:122040/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1223384/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1228410/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1259426/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1270318/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1357497/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1379601/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1408978/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1537963/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1543725/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1630851/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:166833/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1735654/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1851944/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1880618/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1883059/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:192746/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:1031746/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTAATACTgaaga  >  1:1339518/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGGTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaaga  >  1:2854782/1‑62 (MQ=255) tCTACCTTTAGCGAGAACGTCTAAGGTATGATGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTgaagc  >  1:189586/1‑61 (MQ=255) |                                                              TCTACCTTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGA  >  W3110S.gb/4538682‑4538743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑