Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3227308	3227312	5	80 [0]	[0] 22	ygjJ	conserved hypothetical protein

ACGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTA  >  W3110S.gb/3227248‑3227307                                                            | aCGCGCCGACTGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:144143/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGTCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1431156/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGAGGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1451518/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:538683/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:555854/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:500581/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:489985/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:473384/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:453095/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:447080/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:442714/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:440734/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:421854/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:420562/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:380682/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:380417/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:334954/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:330976/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:329017/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:271574/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:245375/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:769615/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:988018/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:981002/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:93533/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:900237/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:89716/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:885987/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:879885/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:858368/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:830935/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:813795/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1636055/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:729077/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:7014/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:692991/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:663561/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:606891/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:605424/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:590950/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:578722/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:575597/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1120066/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1258757/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1252284/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1247595/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1210170/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:11895/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1185924/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1165336/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1133653/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1130724/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1258887/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1080970/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1055773/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1041747/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1036770/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1035738/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1030555/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1026093/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1022849/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:143493/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1010752/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1632291/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1625302/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1594076/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1584718/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:154082/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1528161/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1518526/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1437141/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:204284/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1431584/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1356261/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1334236/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1334096/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1333052/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1290055/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1267895/1‑60 (MQ=255) aCGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTa  >  1:1263031/1‑60 (MQ=255)                                                            | ACGCGCCGACGGGCTGGACGTACCGGGAAGTGAAAGTGGGATGATGGTGAGCGCCATGTA  >  W3110S.gb/3227248‑3227307

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑