Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3227308	3227312	5	80 [0]	[0] 22	ygjJ	conserved hypothetical protein

CGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCT  >  W3110S.gb/3227313‑3227374 |                                                              cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGc   >  1:1048436/1‑61 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:600691/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:994973/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:822183/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:785641/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:774206/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:757701/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:696813/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:659608/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:649006/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:638167/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:632265/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:579690/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:448540/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:374625/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:338263/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:303570/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:1650278/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:1291575/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:1153749/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:1081993/1‑62 (MQ=255) cGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCt  >  1:10773/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGTTAAAGGGCGTTTATCTCTCCACCGCTTACACCTACGCCAAACATCGCCCTGACCACGCT  >  W3110S.gb/3227313‑3227374

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑