Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4176682	4176725	44	16 [0]	[0] 77	gspK	general secretory pathway component, cryptic

GCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCTT  >  W3110S.gb/4176634‑4176681                                                | gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1047490/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1085495/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1248905/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1333390/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1399026/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1434030/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:1435872/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:148767/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:279888/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:465009/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:465757/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:471028/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:561956/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:632832/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:873896/48‑1 (MQ=255) gCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCtt  <  1:898044/48‑1 (MQ=255)                                                | GCGGCTATAGGGAAAGAGATGCCTTTTCACCTGAGCAACCAGTGGCTT  >  W3110S.gb/4176634‑4176681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑