Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1035354	1035904	551	46 [0]	[0] 40	[hyaB]–[hyaC]	[hyaB],[hyaC]

CGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCC  >  W3110S.gb/1035292‑1035353                                                              | cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGTAGCGGCGCTGATGAACTCCAAAATGGCGATcc  <  1:567950/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:591603/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1639778/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:225000/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:233686/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:104183/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:357871/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:38207/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:385731/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:387723/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:291723/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:691057/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:780154/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:800765/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:830783/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:834909/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:858325/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:920666/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:940667/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:992168/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1350906/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:108967/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1097290/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1119366/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1159763/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1170137/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:124208/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1260414/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1326731/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1348808/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1609091/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:137925/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:140966/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1417095/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1427263/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1429038/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1491988/62‑1 (MQ=255) cgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:154050/62‑1 (MQ=255)  gATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:474529/61‑1 (MQ=255)  gATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:592317/61‑1 (MQ=255)  gATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:799402/61‑1 (MQ=255)  gATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:337515/61‑1 (MQ=255)  gATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:959537/61‑1 (MQ=255)       cAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:546857/56‑1 (MQ=255)             gCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:345966/50‑1 (MQ=255)                  ttGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATcc  <  1:1425790/45‑1 (MQ=255)                                                              | CGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCC  >  W3110S.gb/1035292‑1035353

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑