Missing coverage evidence...
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TCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCC  >  W3110S.gb/1035905‑1035953 |                                                 tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:565917/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:210501/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:309289/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:341024/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:37260/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:398732/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:446966/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:517369/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:553183/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:555157/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:18017/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:659054/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:754267/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:770526/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:830989/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:849229/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:851439/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:874296/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:882529/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:93321/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1222984/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1015463/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1020362/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1020762/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1032295/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1132057/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1132244/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1150333/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1176988/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1209537/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:101266/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:128488/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1292973/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1306160/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1309051/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1311115/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1377905/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1507513/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1566171/49‑1 (MQ=255) tCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGcc  <  1:1620577/49‑1 (MQ=255) |                                                 TCGGTCTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCC  >  W3110S.gb/1035905‑1035953

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑