Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1142489	1142764	276	46 [0]	[0] 37	[flgL]–[rne]	[flgL],[rne]

AGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATGCAG  >  W3110S.gb/1142427‑1142488                                                              | aggagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:237905/59‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:651085/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:426967/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:481242/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:509436/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:518583/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:523329/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:565863/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:574453/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:598635/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:599276/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:650534/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:426617/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:6863/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:70462/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:751583/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:801177/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:80849/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:862926/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:869914/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:873589/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:925736/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:993070/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1471630/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:107643/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1158251/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:116843/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1247148/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1272099/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1337442/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:142202/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:143021/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1441815/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1454242/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1027352/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1494143/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1516049/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:166154/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:255180/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:301779/62‑1 (MQ=255) agcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:374786/62‑1 (MQ=255)  gcagATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:892792/61‑1 (MQ=255)                     gATGTGGACTTGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1627976/42‑1 (MQ=255)                         tgGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:1482932/38‑1 (MQ=255)                           gACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:269355/36‑1 (MQ=255)                           gACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATgcag  <  1:333499/36‑1 (MQ=255)                                                              | AGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTATTTCATCTTACATCATGCAG  >  W3110S.gb/1142427‑1142488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑