Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1142489	1142764	276	46 [0]	[0] 37	[flgL]–[rne]	[flgL],[rne]

AACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGG  >  W3110S.gb/1142765‑1142826 |                                                              aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGAtgtg                       >  1:786476/1‑41 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGacca         >  1:1028859/1‑55 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTg     >  1:376130/1‑59 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGc    >  1:388087/1‑60 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:972604/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:889850/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:805701/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:795957/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:975505/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:723762/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:717982/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:702331/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:637514/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:605796/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:496633/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:450781/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:414954/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:98605/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:99749/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1457461/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1032676/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1079837/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1129164/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1137836/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1297374/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1406020/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1415384/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:394748/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1525403/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1570682/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:1619981/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:238016/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:251060/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:311272/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:371931/1‑62 (MQ=255) aaCAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCg   >  1:1110580/1‑61 (MQ=255) aaCAGGATGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCgg  >  1:625830/1‑62 (MQ=255) |                                                              AACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGG  >  W3110S.gb/1142765‑1142826

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑