Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1274283	1274370	88	74 [0]	[0] 60	chaC	regulatory protein for cation transport

GGTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGT  >  W3110S.gb/1274221‑1274282                                                              | ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:304325/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:497899/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:476421/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:461258/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:430381/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:40917/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:404930/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:389989/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:332987/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:511355/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:289865/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:279294/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:237058/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:232293/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1002339/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:208827/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:181416/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:808598/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:996373/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:987958/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:935682/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:931866/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:887758/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:865253/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:851893/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:849844/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:227236/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:802904/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:773369/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:753463/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:725260/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:539219/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:525929/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:525573/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1382219/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1191980/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1188556/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1108593/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1308632/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1317225/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1321147/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:132575/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1081581/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:178151/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1354597/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1355315/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1374601/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1413290/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1438347/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1012746/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:162713/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1021645/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1584065/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1582561/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1022914/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:153761/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1523567/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1030648/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1463598/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1437218/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGGGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:558083/62‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGGGGAAGCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1579159/62‑1 (MQ=255)  gtttgGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:772826/58‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGACTCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:527725/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGGACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1555464/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1326339/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1231217/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1252092/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:538087/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:400851/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1551599/61‑1 (MQ=255)  gtgtGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1651426/61‑1 (MQ=255)             cGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:1605998/50‑1 (MQ=255)                     gATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGt  <  1:933612/42‑1 (MQ=255)                                                              | GGTGTGGATCTTCGGCTATGGATCGTTGATGTGGAATCCGGCACTGGAGTTTACCGAATCGT  >  W3110S.gb/1274221‑1274282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑