Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2109049	2109180	132	71 [0]	[0] 97	wbbH	O‑antigen polymerase

GTAAGCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGA  >  W3110S.gb/2108988‑2109048                                                             | gtaagCTAGTCCCGAATTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:610310/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:598200/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:763940/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:760036/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:745961/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:711115/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:685815/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:656669/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:618838/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:769209/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:577864/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:565127/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:534994/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:503240/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:489410/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:448399/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:416940/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:402901/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:877936/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:993406/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:949748/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:933264/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:931548/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:924732/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:920699/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:896183/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:886980/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:332699/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:868871/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:866080/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:832185/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:820312/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:790274/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:783045/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:774968/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1189247/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1373621/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1356277/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:133598/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1322950/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1315097/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1289508/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1234446/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:121165/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1391209/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1180882/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1177329/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:113411/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1099660/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1091087/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1066153/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1065102/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1012467/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1646506/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:261636/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:259844/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:249085/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:247378/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:210825/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:197258/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:185728/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1009538/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1635889/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1630305/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1620918/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1602963/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1533712/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:150825/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1440241/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:1421771/1‑61 (MQ=255) gtaagCTAGTCACGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGa  >  1:507823/1‑61 (MQ=255)                                                             | GTAAGCTAGTCCCGAACTGGTAGTTACTTAACCTCATGCATATATATATCATCGAAAAAGA  >  W3110S.gb/2108988‑2109048

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑