Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2985851	2986139	289	57 [0]	[1] 89	yqeG/yqeH	predicted transporter/conserved hypothetical protein with bipartite regulator domain

ATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTA  >  W3110S.gb/2985789‑2985850                                                              | atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:723778/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:293510/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:31970/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:32520/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:338622/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:363834/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:374504/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:384519/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:397940/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:430457/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:437171/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:526762/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:561375/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:647728/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:246882/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:798676/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:838430/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:842438/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:881929/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:890078/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:893669/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:931557/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:967048/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:967812/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:972023/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:977724/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:978237/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:979527/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1383396/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1085415/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1102913/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1103170/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1117848/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1161201/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:118738/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1217746/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1237863/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1294626/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1296069/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1348320/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1353269/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1376202/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1005579/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1421398/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1447404/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1493573/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1539760/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1591088/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1619246/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1638195/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1642565/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:220056/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:236277/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:239042/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:240383/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTCCACCCTATAACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:1344509/1‑62 (MQ=255) atatTCATTTGTTATTATTACCCCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtta  >  1:354893/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTA  >  W3110S.gb/2985789‑2985850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑