Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2985851	2986139	289	57 [0]	[1] 89	yqeG/yqeH	predicted transporter/conserved hypothetical protein with bipartite regulator domain

CATCATCAATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATGG  >  W3110S.gb/2986136‑2986195     |                                                        tatcatcAATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:528573/59‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACTTgg  <  1:524720/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:487605/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:661019/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:643357/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:613388/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:611619/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:607024/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:577954/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:575216/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:490471/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:706474/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:484575/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:483145/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:467985/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:446179/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:424337/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:422107/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:415681/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:402020/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:399960/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:398722/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:849719/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:998780/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:995701/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:993989/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:98029/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:970709/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:966140/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:931053/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:919287/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:9047/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:852922/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:382366/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:83053/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:830508/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:792347/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:782738/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:749970/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:745262/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:7243/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:719128/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:713341/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:712714/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:129732/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1524478/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1495773/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1485944/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1470620/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1448601/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1393825/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:137598/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1341295/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1334205/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1307417/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1304363/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:330527/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:12696/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1214058/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1183349/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1156351/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1136120/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1135475/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1131826/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1102065/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:110176/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1093731/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1629194/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1084261/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:282281/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:265084/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:249934/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:24292/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:222491/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:217519/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:206209/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:186459/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:163603/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1619749/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:161243/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1586693/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1583006/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1569941/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1560477/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1558969/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1556946/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1536290/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATgg  <  1:1530382/56‑1 (MQ=255)     atcaATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTAAACATgg  <  1:683555/56‑1 (MQ=255)     |                                                        CATCATCAATAACCAATGAAATTATGCAATTATATACGGATAGGGAGGTTCTTAACATGG  >  W3110S.gb/2986136‑2986195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑