Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3158366	3158711	346	38 [0]	[0] 83	ygiQ	conserved hypothetical protein

TGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACG  >  W3110S.gb/3158305‑3158365                                                             | tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:783944/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1020461/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:502269/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:560136/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:578394/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:660788/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:680269/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:681415/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:681440/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:774720/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:453741/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:808481/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:814614/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:823169/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:868697/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:880609/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:965799/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:968499/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:981379/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1320012/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1047775/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1086191/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1092677/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1150975/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1156272/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1170841/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1205283/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1303665/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:44225/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1455018/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1456764/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1519648/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:1534335/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:156819/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:187728/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:324455/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:356915/1‑61 (MQ=255) tGTCATAACGCACAACAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  >  1:805089/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACG  >  W3110S.gb/3158305‑3158365

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑