Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3158366	3158711	346	38 [0]	[0] 83	ygiQ	conserved hypothetical protein

GCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAG  >  W3110S.gb/3158712‑3158773 |                                                              gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCaaaaa                           >  1:1629033/1‑37 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGaaa   >  1:429672/1‑61 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGaaa   >  1:1620870/1‑61 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:481033/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:600055/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:555319/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:551881/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:548619/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:539833/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:532631/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:520730/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:519118/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:515486/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:486532/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:676220/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:458397/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:414207/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:402085/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:387532/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:379194/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:340764/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:772410/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:918751/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:91418/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:909966/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:887913/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:879810/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:829964/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:827669/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:809632/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:800561/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:77283/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:296010/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:74915/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:743379/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:73310/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:730833/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:726667/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:713978/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:705479/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:702255/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:677455/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1235843/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:134015/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:133676/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1334680/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1317228/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1308750/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1297464/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1296695/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1291023/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1258964/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1369301/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1150743/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1106813/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1096506/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1084892/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1054695/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1043051/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1039972/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1028162/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1023275/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1542934/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1006985/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:2742/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:270424/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:210300/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1641467/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1625091/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1602827/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1581514/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1568042/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:156380/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:335473/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1531696/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1520746/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1492999/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1476909/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1438359/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1430560/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1377274/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAg  >  1:1371053/1‑62 (MQ=255) gCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCAGCTCTTCGGTAGaaa   >  1:688542/1‑61 (MQ=255) |                                                              GCCGGATGTGGCACGCGCTTGTATGGCAGCGCAAAAACGCTGTCCATCTCTTCGGTAGAAAG  >  W3110S.gb/3158712‑3158773

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑