Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3187964	3187995	32	47 [0]	[0] 33	yqiG	predicted outer membrane usher protein

ATACCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTG  >  W3110S.gb/3187902‑3187963                                                              | ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:453588/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:219180/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:234894/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:266113/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:277462/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:382267/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:40156/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:416161/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:426978/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:433681/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:442954/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:447351/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:213608/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:518151/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:553851/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:687999/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:719947/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:730176/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:767850/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:78047/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:801994/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:872606/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:895936/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1381714/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1051347/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:110000/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1168059/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1210509/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1210510/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1219806/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1236342/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1241393/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1304424/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1336039/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:100475/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1412040/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:143734/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1448691/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1462732/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1519190/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1543907/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1573032/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:161471/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1623136/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1624483/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:1624755/1‑62 (MQ=255) ataCCGAGAACGGGCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTg  >  1:596484/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATACCGAGAACGGTCGACTCTACCTCTCCGGTACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTG  >  W3110S.gb/3187902‑3187963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑