Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3187964	3187995	32	47 [0]	[0] 33	yqiG	predicted outer membrane usher protein

TCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACG  >  W3110S.gb/3187996‑3188057 |                                                              tCGCCACGGTGCCGGTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:71305/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:600167/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:38809/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:394940/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:484171/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:484725/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:514381/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:520759/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:577013/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:599238/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:384052/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:620159/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:719110/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:867419/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:903296/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:912535/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:938720/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1090491/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:383131/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:369190/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:311437/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:171337/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1641677/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1606594/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:152212/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1500075/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:147865/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:145972/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1326308/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1301662/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1241487/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:1153834/62‑1 (MQ=255) tCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACg  <  1:112334/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCGCCACGGTGCCGCTTTCCACGACTATAGCGGTAGTGCTGACTCGCGTTTTATGATCGACG  >  W3110S.gb/3187996‑3188057

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑