Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	249132	249559	428	126 [0]	[0] 53	fhiA	ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

CCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA  >  W3110S.gb/249560‑249621 |                                                              ccAGCACGAACATAATCCCGTTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  >  1:245864/1‑62 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGCGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  >  1:699671/1‑62 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCa                            >  1:1341014/1‑36 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCGCCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  >  1:723599/1‑62 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGCCGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  >  1:1136212/1‑62 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGTGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  >  1:1347425/1‑62 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGtt   >  1:1296988/1‑61 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGtt   >  1:1370006/1‑61 (MQ=255) ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGt    >  1:969084/1‑60 (MQ=255) 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|                                                              CCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA  >  W3110S.gb/249560‑249621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑