Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	314251	314328	78	35 [0]	[0] 27	eaeH	attaching and effacing protein, pathogenesis factor

CGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGT  >  W3110S.gb/314329‑314390 |                                                              cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:231658/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:978117/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:898258/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:864824/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:745452/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:698177/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:652222/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:621695/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:560669/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:525644/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:440133/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:412336/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:397166/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:250504/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1093036/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:199402/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1640630/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:157472/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1554413/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1477445/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1471190/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1466030/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1419903/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1352460/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1317877/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1237727/62‑1 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGt  <  1:1173722/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCAGCTTGGCGCAAGCCTGATGTATGAACAGTATTATGGCGATGAAGTCGGGCTGTTTGGT  >  W3110S.gb/314329‑314390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑