Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1607495	1607678	184	81 [0]	[0] 96	lsrB	AI2 transporter

GCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATC  >  W3110S.gb/1607679‑1607727 |                                                 gCCAAACAGCTTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATTGTAATGGCATc  <  1:325515/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:533273/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:68556/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:681566/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:659101/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:647314/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:633303/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:602262/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:59818/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:5937/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:588980/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:566522/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:54296/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:694067/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:515800/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:506520/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:504586/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:503657/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:479250/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:437658/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:425248/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:409468/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:391436/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1001588/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:888046/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:991725/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:987574/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:987464/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:982176/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:96105/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:956042/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:948426/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:941924/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:937426/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:896125/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:889358/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:309246/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:875385/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:872975/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:853056/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:849278/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:837282/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:79866/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:774442/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:72855/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:719053/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:704786/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:700744/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1078183/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1270304/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1259134/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1255022/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1246374/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1171655/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1152711/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1144899/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1103588/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:109835/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1098164/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:109134/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1274943/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1069747/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1065586/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1060504/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1041289/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1033751/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1032523/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1029340/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:10276/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1022773/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1018431/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:100261/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1583468/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:298473/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:293146/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:260477/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:250768/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:247683/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:227076/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:204634/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:201003/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:197736/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1600566/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:301308/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1525926/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1469891/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:146487/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1464648/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1412233/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1384213/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1343683/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1317301/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1308849/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1294388/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATc  <  1:1280111/49‑1 (MQ=255) gCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGAAATGGCATc  <  1:47156/49‑1 (MQ=255) |                                                 GCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATC  >  W3110S.gb/1607679‑1607727

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑