New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | minE | 369453 = | 61 (0.990) | 6 (0.130) +TGTGCGGCCGTC |
3/74 | NT | 12.8% | coding (400/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
? | minE | = 425443 | 48 (0.780) | coding (610/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
AGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATATT > minE/369390‑369521 | aGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTa > 1:1241683/1‑71 (MQ=255) cGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTAt > 1:1239499/1‑70 (MQ=255) cGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATc < 1:5058258/71‑1 (MQ=255) gTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATc < 1:1761212/60‑1 (MQ=255) gTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATc < 1:885467/60‑1 (MQ=255) tAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCAc > 1:3241471/1‑70 (MQ=255) aaCCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTAt > 1:1845064/1‑65 (MQ=255) aaCCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCAt > 1:3602701/1‑71 (MQ=255) ccACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCAttt < 1:2844729/71‑1 (MQ=255) tCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTc > 1:2167947/1‑71 (MQ=255) tCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTc < 1:1336810/71‑1 (MQ=255) tCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTc < 1:1891431/71‑1 (MQ=255) tcatcaGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATg > 1:4712021/1‑71 (MQ=255) tcatcaGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATg > 1:1924843/1‑71 (MQ=255) tcatcaGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATg > 1:995999/1‑71 (MQ=255) atcaGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCa > 1:2082894/1‑52 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCttt < 1:2535757/71‑1 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCttt < 1:2391484/71‑1 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCtt > 1:5522713/1‑70 (MQ=255) tcTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCtt > 1:1776808/2‑69 (MQ=255) gCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCtt > 1:2234977/1‑69 (MQ=255) cTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGt < 1:2727925/42‑1 (MQ=255) cTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGt < 1:925018/42‑1 (MQ=255) cTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg > 1:5427497/1‑71 (MQ=255) aTACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg < 1:1925238/68‑1 (MQ=255) tACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTc > 1:2983910/1‑71 (MQ=255) tACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTc < 1:5232957/71‑1 (MQ=255) tACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTc < 1:1968567/71‑1 (MQ=255) aCAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTcc > 1:2271180/1‑71 (MQ=255) aCAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTcc > 1:781500/1‑71 (MQ=255) cAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTccc > 1:2286729/1‑71 (MQ=255) aGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTAt < 1:1379141/38‑1 (MQ=255) gTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGa > 1:2422777/1‑53 (MQ=255) gTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGc > 1:1798046/1‑71 (MQ=255) tGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGcc < 1:3659875/71‑1 (MQ=255) tGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGcc < 1:460485/71‑1 (MQ=255) ggaaaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCAcc > 1:5142248‑M1/26‑38 (MQ=255) ggaaaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCAcc > 1:1516602‑M1/26‑38 (MQ=255) ggaaaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCACCa < 1:3376153‑M1/14‑1 (MQ=255) gCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGcc < 1:4592589/69‑1 (MQ=255) gCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAt < 1:4050148/71‑1 (MQ=255) gCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAt < 1:4157797/71‑1 (MQ=255) cGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGttt < 1:1375231/61‑1 (MQ=255) cGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAtt < 1:5098935/71‑1 (MQ=255) cGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAtt < 1:4341581/71‑1 (MQ=255) aaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCAcc < 1:5392012‑M1/13‑1 (MQ=255) aaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCAcc < 1:3978948‑M1/13‑1 (MQ=255) aaccggctttgacggccgcacaCAGCGTTATCAcc < 1:4272849‑M1/13‑1 (MQ=255) gATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTAc < 1:728508/71‑1 (MQ=255) aTAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg < 1:5366492/55‑1 (MQ=255) aTAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg < 1:2812927/55‑1 (MQ=255) aTAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg < 1:5029980/55‑1 (MQ=255) aTAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAg < 1:1003969/55‑1 (MQ=255) aTAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTAcc > 1:1134272/1‑71 (MQ=255) tAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTa > 1:4912675/1‑68 (MQ=255) tAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTAccc < 1:4628370/71‑1 (MQ=255) aCCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc < 1:5261512/71‑1 (MQ=255) aCCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc < 1:5254994/71‑1 (MQ=255) cGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc > 1:871152/1‑69 (MQ=255) ggtactggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc > 1:4135682/1‑65 (MQ=255) ggtactggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc > 1:5390516/1‑65 (MQ=255) ggtactggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGc > 1:5242161/1‑65 (MQ=255) actggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGc > 1:4156530/1‑70 (MQ=255) actggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGc > 1:3189186/1‑70 (MQ=255) ctggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGcc > 1:1354629/1‑70 (MQ=255) ctggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCa < 1:1305833/71‑1 (MQ=255) tggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGTCCAt < 1:3844072/53‑1 (MQ=255) tggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAt < 1:3831397/53‑1 (MQ=255) tggtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCAt < 1:3596170/53‑1 (MQ=255) gtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAata > 1:5354564/1‑71 (MQ=255) gtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAata < 1:5249370/71‑1 (MQ=255) gtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAat < 1:5550798/70‑1 (MQ=255) gtaTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAat < 1:3535266/70‑1 (MQ=255) taTCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGa < 1:4239364/61‑1 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTa > 1:4063158/1‑35 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTa > 1:1541124/1‑35 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTa > 1:4724729/1‑35 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTcc < 1:1374188/41‑1 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATAtt > 1:347234/1‑70 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATAtt > 1:5694612/1‑70 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATAtt > 1:1804204/1‑70 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATAtt < 1:957568/70‑1 (MQ=255) tCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATAtt < 1:4391192/70‑1 (MQ=255) | AGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATATT > minE/369390‑369521 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |