| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 662721 | 86 (1.400) | 4 (0.080) +TCTCGGCA |
3/82 | NT | 5.8% | coding (71/543 nt) | ycbW | hypothetical protein |
| ? | minE | 2124983 = | 71 (1.160) | coding (20/444 nt) | yhbP | conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGCGAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCTTTTCTCCCGC > minE/662652‑662790 | tGCGAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGAttt < 1:2090926/70‑1 (MQ=255) gCGAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAg > 1:1725206/1‑71 (MQ=255) cGAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGc > 1:796193/1‑71 (MQ=255) gAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGcc < 1:4477657/71‑1 (MQ=255) gAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGcc < 1:62529/71‑1 (MQ=255) gAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGcc < 1:5054960/71‑1 (MQ=255) aTTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCaa > 1:674250/1‑71 (MQ=255) aTTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCaa > 1:725869/1‑71 (MQ=255) ttAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCaa > 1:1926333/1‑70 (MQ=255) ttAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAAt < 1:2923830/71‑1 (MQ=255) ttAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAAt > 1:1068602/1‑71 (MQ=255) ttAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAAt > 1:699586/1‑71 (MQ=255) aaaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATgg > 1:421002/1‑71 (MQ=255) aaaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATgg > 1:2327358/1‑71 (MQ=255) aaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGAttt < 1:2524692/61‑1 (MQ=255) aaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATgg < 1:1984786/70‑1 (MQ=255) aaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATgg > 1:2059218/1‑70 (MQ=255) aaCCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATgg > 1:4018664/1‑70 (MQ=255) cAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:640349/1‑69 (MQ=255) cAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:1521238/1‑69 (MQ=255) aGACTATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGc < 1:3147668/71‑1 (MQ=255) gACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGc > 1:1071697/1‑70 (MQ=255) gACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGc > 1:5319645/1‑70 (MQ=255) aCGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAg < 1:4367102/57‑1 (MQ=255) aCGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAg < 1:1992119/57‑1 (MQ=255) aCTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGc < 1:4654142/71‑1 (MQ=255) aCTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGc < 1:3647988/71‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCt > 1:3730652/1‑70 (MQ=255) ttGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGt < 1:5450635/52‑1 (MQ=255) ttGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGtt < 1:1589676/71‑1 (MQ=255) ggTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGAttt > 1:1399562/1‑40 (MQ=255) ggTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGAttt > 1:74396/1‑40 (MQ=255) tATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgc < 1:3970744/71‑1 (MQ=255) aTTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGtttt > 1:3763472/1‑68 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAg < 1:3209240/38‑1 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAg < 1:4202088/38‑1 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:2584946/1‑47 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:2833957/1‑47 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:606063/1‑47 (MQ=255) ttACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTa > 1:3953191/1‑47 (MQ=255) aCGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgcgcg > 1:1132781/1‑70 (MQ=255) aCGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgcg > 1:525440/1‑68 (MQ=255) aCGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgcg > 1:1424816/1‑68 (MQ=255) gATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTAAGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCaa < 1:3525238/71‑1 (MQ=255) gAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTAtt < 1:1017064/47‑1 (MQ=255) aaGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGAt < 1:1976324/70‑1 (MQ=255) aaGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATg < 1:4977384/71‑1 (MQ=255) gagCACGATCGAATGATGCTCTATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:5459783/71‑1 (MQ=255) gagCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgc < 1:920179/59‑1 (MQ=255) gagCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:2737569/71‑1 (MQ=255) gagCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTAAGCTATTTCGCTCACGTTTTgcg > 1:4726239/1‑60 (MQ=255) cACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGt < 1:3171320/51‑1 (MQ=255) cACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGt < 1:2232802/51‑1 (MQ=255) cACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt > 1:2095446/1‑68 (MQ=255) aCGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACt > 1:462590/1‑71 (MQ=255) cGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTc > 1:3153035/1‑71 (MQ=255) gATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:2880994/65‑1 (MQ=255) gATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:452400/65‑1 (MQ=255) aTCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCa < 1:2543671/71‑1 (MQ=255) aTCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCa < 1:1258620/71‑1 (MQ=255) aTCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCa < 1:905564/71‑1 (MQ=255) tCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCCCGtttt > 1:3506331/1‑49 (MQ=255) tCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAg < 1:4559316/71‑1 (MQ=255) tCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGAGCAAGATGt > 1:4529990/1‑62 (MQ=255) cGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGttt > 1:2948302/1‑47 (MQ=255) cGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTc > 1:5153962/1‑67 (MQ=255) cGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTc > 1:758683/1‑67 (MQ=255) cGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAg < 1:1038288/70‑1 (MQ=255) aaTGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:3997867/60‑1 (MQ=255) aaTGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt < 1:1884776/60‑1 (MQ=255) atgatgCTCGATTTtctcggcaatggcgatgagcgtttc < 1:600848‑M1/39‑26 (MQ=255) atgatgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGc < 1:1922503/71‑1 (MQ=255) tgatgCTCGATTTtctcggcaatggcgatgagcgtttcc < 1:4139731‑M1/39‑27 (MQ=255) tgatgCTCGATTTtctcggcaatggcgatgagcgtttcc < 1:2802734‑M1/39‑27 (MQ=255) tgatgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGcc > 1:1349257/1‑71 (MQ=255) gatgCTCGATTTtctcggcaatggcgatgagcgtttc > 1:5187417‑M1/1‑12 (MQ=255) gatgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGtt > 1:268937/1‑57 (MQ=255) gatgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCt > 1:4113681/1‑71 (MQ=255) gatgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCt > 1:2200937/1‑71 (MQ=255) atgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCtt < 1:929782/71‑1 (MQ=255) atgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCtt < 1:114402/71‑1 (MQ=255) atgCTAGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCAGGTTTTGCGCGCaa < 1:4562791/50‑1 (MQ=255) tgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTgcgc > 1:1732979/1‑45 (MQ=255) tgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCaa > 1:4153097/1‑49 (MQ=255) tgCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCaa > 1:781903/1‑49 (MQ=255) cTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCaa < 1:1770435/47‑1 (MQ=255) cTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCaa < 1:5090101/47‑1 (MQ=255) cTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCTTTtc < 1:245775/71‑1 (MQ=255) gATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCTTTTCTcc > 1:906155/1‑71 (MQ=255) gATTTAGCCAATGGTATGCTATATCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGca > 1:1237071/1‑62 (MQ=255) aTTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGtttt < 1:3091512/35‑1 (MQ=255) aTTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGtttt < 1:3854580/35‑1 (MQ=255) aTTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGtttt < 1:2358622/35‑1 (MQ=255) aTTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATg < 1:850533/47‑1 (MQ=255) tttAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGa < 1:635917/44‑1 (MQ=255) tttAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGa < 1:2301061/44‑1 (MQ=255) tttAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATg < 1:2141406/59‑1 (MQ=255) ttAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATg < 1:2785422/58‑1 (MQ=255) tAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATg > 1:4110934/1‑44 (MQ=255) tAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCTTTTCTCCCGc < 1:463921/70‑1 (MQ=255) | TGCGAATTAAACCAGACGATAACTGGCGTTGGTATTACGATGAAGAGCACGATCGAATGATGCTCGATTTAGCCAATGGTATGCTATTTCGCTCACGTTTTGCGCGCAAGATGTTGACTCCAGATGCCTTTTCTCCCGC > minE/662652‑662790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |