| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 122444 = | 39 (0.640) | 6 (0.120) +GGTAGAGTAC |
3/78 | NT | 9.3% | coding (622/1551 nt) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| ? | minE | = 2498641 | 109 (1.780) | coding (1181/1689 nt) | ilvB | acetolactate synthase I, large subunit | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTG > minE/2498572‑2498708 | aCGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCa > 1:878540/1‑70 (MQ=255)aCGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCAt > 1:4497340/1‑71 (MQ=255)aCGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCAt > 1:4347836/1‑71 (MQ=255)aCGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCAt > 1:2904063/1‑71 (MQ=255) cGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCAt < 1:765110/70‑1 (MQ=255) ccTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGa < 1:3536281/71‑1 (MQ=255) cTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAt < 1:4556724/71‑1 (MQ=255) tGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtg > 1:881991/1‑71 (MQ=255) tGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtg > 1:1197619/1‑71 (MQ=255) aTCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgt < 1:1006622/70‑1 (MQ=255) tCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTgg < 1:2021079/71‑1 (MQ=255) cAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGa > 1:3551441/1‑71 (MQ=255) cAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGa > 1:3864994/1‑71 (MQ=255) aaCGCCGTTGCCGCATGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtg < 1:4477424/66‑1 (MQ=255) aCGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGAcc > 1:2279311/1‑71 (MQ=255) gCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgtg < 1:1975509/65‑1 (MQ=255) cGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCgcgc < 1:4759613/71‑1 (MQ=255) ttGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCa < 1:3358342/55‑1 (MQ=255) ttGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCa < 1:2521850/55‑1 (MQ=255) ttGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCaa < 1:1854897/71‑1 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATc > 1:5546204/1‑52 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATc > 1:678252/1‑52 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGa > 1:1397829/1‑55 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGa > 1:5567266/1‑61 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc > 1:1960136/1‑71 (MQ=255) gccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc > 1:2168958/1‑71 (MQ=255) ccgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGAc > 1:374065/1‑61 (MQ=255) cgccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt < 1:4129421/71‑1 (MQ=255) gccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCa > 1:1150808/1‑47 (MQ=255) gccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCa > 1:5330076/1‑47 (MQ=255) gccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTa < 1:1685832/71‑1 (MQ=255) gccTGTGTCGATGACAATGCAATCATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTa < 1:480254/71‑1 (MQ=255) ccTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTAt > 1:3967074/1‑71 (MQ=255) cTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTgg < 1:4931351/55‑1 (MQ=255) cTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTgg < 1:5453390/55‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAg < 1:5379262/48‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgtg < 1:2900820/53‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgtg < 1:3447410/53‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgtg < 1:1294480/53‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAtgtg < 1:3869073/53‑1 (MQ=255) tgtgTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATcc > 1:4060159/1‑71 (MQ=255) tgtCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAt > 1:162344/1‑48 (MQ=255) tgtCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGAt > 1:1770263/1‑48 (MQ=255) tCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt < 1:2717489/63‑1 (MQ=255) tCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt < 1:3534871/63‑1 (MQ=255) tCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATccctc < 1:820537/70‑4 (MQ=255) tCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCt > 1:5209866/1‑70 (MQ=255) aTGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:2250185/58‑1 (MQ=255) gACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATcc > 1:2352360/1‑62 (MQ=255) gACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATcc > 1:4671943/1‑62 (MQ=255) aaTGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCGGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATcc > 1:192817/1‑59 (MQ=255) aaTGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATcc > 1:2326421/1‑59 (MQ=255) aaTGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGcc > 1:150591/1‑70 (MQ=255) tGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt > 1:1841740/1‑53 (MQ=255) tGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt > 1:4307517/1‑53 (MQ=255) tGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt > 1:1567308/1‑53 (MQ=255) tGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTa < 1:619536/54‑1 (MQ=255) tGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCAc < 1:332361/71‑1 (MQ=255) gCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCtt < 1:1222138/52‑1 (MQ=255) cAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGc < 1:301541/71‑1 (MQ=255) aaTTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGcc < 1:1663113/71‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:3823941/46‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:1000139/46‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:255414/46‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:941534/46‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGc < 1:14718/46‑1 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGc > 1:5379674/1‑68 (MQ=255) ttATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGc > 1:384547/1‑68 (MQ=255) tATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGc > 1:2627575/1‑61 (MQ=255) aTCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATc > 1:4030551/1‑58 (MQ=255) aTCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTg > 1:3683532/1‑71 (MQ=255) tCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGt < 1:406751/69‑1 (MQ=255) tCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGt < 1:4780575/69‑1 (MQ=255) accaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAAt > 1:2048956/1‑54 (MQ=255) accaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAAt > 1:624034/1‑54 (MQ=255) accaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTTGc < 1:1849767/70‑1 (MQ=255) accaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCt < 1:5061846/71‑1 (MQ=255) cccccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCt < 1:5117388/67‑1 (MQ=255) ccaccGGCGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCa > 1:733863/1‑59 (MQ=255) ccaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCa > 1:5476991/1‑59 (MQ=255) ccaccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATAGCCCa > 1:4651997/1‑59 (MQ=255) caccGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTg < 1:2893105/70‑1 (MQ=255) accGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCa < 1:1689192/49‑1 (MQ=255) accGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCa < 1:651810/49‑1 (MQ=255) accGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGAc < 1:3115848/71‑1 (MQ=255) cGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCt < 1:3820013/71‑1 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCAgtactctaccggctggtttggcgat < 1:136032‑M2/38‑26 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCAgtactctaccggctggtttggcga > 1:5553900‑M2/1‑13 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCAgtactctaccggctggtttggcga < 1:160866‑M2/37‑25 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCaa > 1:3653859/1‑46 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCg > 1:1995244/1‑49 (MQ=255) aCGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTcc < 1:4027963/71‑1 (MQ=255) cGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCg < 1:2382756/71‑1 (MQ=255) ttGGTCAGCAgtactctaccggctggtttggcgat > 1:489398‑M2/1‑10 (MQ=255) gTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGtggg > 1:1890203/1‑71 (MQ=255) tCAGCATCAGATGTGGACCGCTCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGcc < 1:2750720/50‑1 (MQ=255) tCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGtgggc < 1:970164/71‑1 (MQ=255) aGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCa > 1:649960/1‑49 (MQ=255) aGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGtgggctg > 1:1755567/1‑71 (MQ=255) aGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGtgggct < 1:3256930/70‑1 (MQ=255) | ACGGCCTGATCAACGCCGTTGCCGCCTGTGTCGATGACAATGCAATTATCACCACCGACGTTGGTCAGCATCAGATGTGGACCGCGCAAGCTTATCCGCTCAATCGCCCACGCCAGTGGCTGACCTCCGGTGGGCTG > minE/2498572‑2498708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |