| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 384735 = | 100 (1.360) | 8 (0.130) | 3/84 | NT | 11.2% | intergenic (+125/‑56) | ybdB/cstA | conserved hypothetical protein/carbon starvation protein |
| ? | minE | 384764 = | 43 (0.700) | intergenic (+154/‑27) | ybdB/cstA | conserved hypothetical protein/carbon starvation protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGG > minE/384665‑384804 | ttAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACaaa < 1:4029130/71‑1 (MQ=255) tAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACaaa < 1:2908154/70‑1 (MQ=255) agagcactgtccagacgaggtatttccctgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGAt > 1:3462593‑M1/68‑71 (MQ=255) gagcactgtccagacgaggtatttccctgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATg > 1:211063‑M1/67‑71 (MQ=255) gagcactgtccagacgaggtatttccctgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATg < 1:2236400‑M1/5‑1 (MQ=255) cATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATg > 1:2490035/1‑71 (MQ=255) ttGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGtt < 1:2184989/71‑1 (MQ=255) ttGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGtt < 1:184575/71‑1 (MQ=255) tGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta > 1:4509717/1‑71 (MQ=255) gttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta > 1:3277797/1‑70 (MQ=255) gttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta > 1:4199968/1‑70 (MQ=255) ttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTATATTGTACAAAGATGTtata < 1:505616/71‑1 (MQ=255) ttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTtata < 1:1372820/71‑1 (MQ=255) ttaagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTtata < 1:787069/71‑1 (MQ=255) taagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGa < 1:2972114/63‑1 (MQ=255) taagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGa < 1:530033/63‑1 (MQ=255) taagttaaATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGa < 1:618469/63‑1 (MQ=255) aaTATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACaa < 1:1097042/70‑1 (MQ=255) tatTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAAt < 1:46646/71‑1 (MQ=255) tatTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAAt < 1:538455/71‑1 (MQ=255) tatTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAAt < 1:2328832/71‑1 (MQ=255) ttGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAAc < 1:295469/64‑1 (MQ=255) ttGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGt < 1:3806433/71‑1 (MQ=255) ttGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGt < 1:3180348/71‑1 (MQ=255) tGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGt > 1:805726/1‑70 (MQ=255) gtatttccctgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATGTTATAGAAACAAAAt > 1:3774080‑M1/49‑68 (MQ=255) cAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGtt > 1:2292536/1‑49 (MQ=255) cAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGtt > 1:1006806/1‑49 (MQ=255) aaCTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:2067965/1‑65 (MQ=255) aaCTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:3619757/1‑65 (MQ=255) aaCTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACAtctc < 1:81206/71‑1 (MQ=255) tgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagaga > 1:342800‑M1/40‑42 (MQ=255) tgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagaga > 1:839538‑M1/40‑42 (MQ=255) tgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccataga > 1:1295095‑M1/40‑40 (MQ=255) tgatttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccataga > 1:2551708‑M1/40‑40 (MQ=255) cTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTa > 1:2863949/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:3388858/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:500351/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:4653626/1‑71 (MQ=255) ccGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta > 1:2932952/1‑45 (MQ=255) ccGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta > 1:3510736/1‑45 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:2757210‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:1696770‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:164057‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:1632544‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:4633035‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:3171103‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:1409877‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagag > 1:3588005‑M1/37‑38 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATGTTATAGAAACAAAATGt > 1:4319093‑M1/37‑58 (MQ=255) tttgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATGTTATAGAAACAAAATGt > 1:1007514‑M1/37‑58 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:3733253/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:3937684/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:909030/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:153813/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATg > 1:1661596/1‑70 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATg > 1:2218461/1‑70 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAG‑AACAAAATGTAACATCTCTATGGa > 1:1943138/1‑71 (MQ=255) tgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa < 1:4164263‑M1/24‑1 (MQ=255) tgttcatagttgttatccgtgtgcgtgtccatagAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa < 1:2840498‑M1/24‑1 (MQ=255) aTTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac < 1:383367/71‑1 (MQ=255) tACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTtat > 1:83400/1‑40 (MQ=255) tACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACaaaa < 1:2349551/50‑1 (MQ=255) tACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACaaaa < 1:4041358/50‑1 (MQ=255) tACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACaaaa < 1:382278/50‑1 (MQ=255) aTGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta < 1:1499900/36‑1 (MQ=255) aTGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTta < 1:576979/36‑1 (MQ=255) ggTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAAt > 1:2600028/1‑46 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:268962/1‑49 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:1609358/1‑49 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:1648208/1‑49 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:4751761/1‑49 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:1093073/1‑49 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:4629061/1‑49 (MQ=255) ttGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:362571/1‑48 (MQ=255) ttGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTaa > 1:3073670/1‑48 (MQ=255) ttGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAAc < 1:3715607/49‑1 (MQ=255) cTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGAt < 1:4165604/70‑1 (MQ=255) cTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATa < 1:367252/71‑1 (MQ=255) ttgttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAAt > 1:1465683/1‑36 (MQ=255) gttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac > 1:3525956/1‑51 (MQ=255) gttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac > 1:1262671/1‑51 (MQ=255) tAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACAtct < 1:1922272/41‑1 (MQ=255) aaaTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATg < 1:4334023/70‑1 (MQ=255) aaTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGa < 1:1046428/70‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:3727135/45‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:3932696/45‑1 (MQ=255) ttGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATctct > 1:4258825/1‑39 (MQ=255) ttGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTa < 1:719405/40‑1 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATATAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4536201/1‑71 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACAtctc > 1:1462860/1‑36 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGCCACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4019843/1‑71 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1038688/1‑71 (MQ=255) tACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAt < 1:4007680/71‑1 (MQ=255) tACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAt < 1:3239907/71‑1 (MQ=255) cAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAATTCa < 1:3034531/71‑1 (MQ=255) aaaGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAg < 1:476011/71‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:2531839‑M1/70‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:335741‑M1/70‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:1779796‑M1/70‑1 (MQ=255) | TTAACATTGTTAAGTTAAATATTGGTTTCAACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGG > minE/384665‑384804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |