| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 384735 = | 100 (1.360) | 8 (0.130) | 3/84 | NT | 11.2% | intergenic (+125/‑56) | ybdB/cstA | conserved hypothetical protein/carbon starvation protein |
| ? | minE | 384764 = | 43 (0.700) | intergenic (+154/‑27) | ybdB/cstA | conserved hypothetical protein/carbon starvation protein | |||||
AACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTG > minE/384694‑384833 | aaCTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACAtctc < 1:81206/71‑1 (MQ=255) cTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTa > 1:2863949/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:4653626/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:3388858/1‑71 (MQ=255) tCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTAt > 1:500351/1‑71 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATctct < 1:2141338/67‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:3733253/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:3937684/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:909030/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:153813/71‑1 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATg > 1:2218461/1‑70 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATg > 1:1661596/1‑70 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAG‑AACAAAATGTAACATCTCTATGGa > 1:1943138/1‑71 (MQ=255) cGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTACAGAAACAAAATGTAACATCTCTATgg < 1:1447465/71‑1 (MQ=255) aTTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac < 1:383367/71‑1 (MQ=255) aTTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac < 1:2949373/71‑1 (MQ=255) gTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACg > 1:81827/1‑71 (MQ=255) cTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGAt < 1:481650/70‑1 (MQ=255) cTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGAt < 1:4165604/70‑1 (MQ=255) cTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATa < 1:367252/71‑1 (MQ=255) gttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac > 1:1262671/1‑51 (MQ=255) gttAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGac > 1:3525956/1‑51 (MQ=255) aaaTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATg < 1:4334023/70‑1 (MQ=255) aaTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGa < 1:1046428/70‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:3932696/45‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:3727135/45‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:3600876/45‑1 (MQ=255) aTTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGa < 1:4377251/45‑1 (MQ=255) ttGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATctct > 1:4258825/1‑39 (MQ=255) ttGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTa < 1:719405/40‑1 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATATAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4536201/1‑71 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACAtctc > 1:1462860/1‑36 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGCCACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4019843/1‑71 (MQ=255) gTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1038688/1‑71 (MQ=255) tACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAt < 1:3807777/71‑1 (MQ=255) tACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAt < 1:4007680/71‑1 (MQ=255) tACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAAt < 1:3239907/71‑1 (MQ=255) cAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAATTCa < 1:3034531/71‑1 (MQ=255) aaaGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAg < 1:476011/71‑1 (MQ=255) aaaGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAg < 1:1136887/71‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:1779796‑M1/70‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:335741‑M1/70‑1 (MQ=255) AGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAgg < 1:2531839‑M1/70‑1 (MQ=255) ttacattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACa < 1:307803‑M2/34‑1 (MQ=255) ttacattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACa < 1:4164263‑M2/34‑1 (MQ=255) ttacattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACa < 1:2840498‑M2/34‑1 (MQ=255) TTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAAt > 1:1724763‑M1/1‑70 (MQ=255) acattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4319093‑M2/23‑58 (MQ=255) acattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1007514‑M2/23‑58 (MQ=255) acattttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4131834‑M2/23‑58 (MQ=255) ATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATAcc < 1:131311‑M1/71‑1 (MQ=255) attttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAATAAATCAGGGAAATAc > 1:1973777‑M2/21‑68 (MQ=255) attttgtttctataacatctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATAc > 1:3774080‑M2/21‑68 (MQ=255) gAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCg > 1:3822201/1‑71 (MQ=255) aCAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATc < 1:320930/54‑1 (MQ=255) aCAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATc < 1:246139/54‑1 (MQ=255) aCAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCt > 1:2432741/1‑71 (MQ=255) cAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAGCAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTg > 1:3571411/1‑71 (MQ=255) cAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATc < 1:957048/53‑1 (MQ=255) cAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATc < 1:1852244/53‑1 (MQ=255) cAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATc < 1:3554003/53‑1 (MQ=255) cAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTg > 1:3311510/1‑71 (MQ=255) aaaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATg > 1:4231408/1‑44 (MQ=255) aaaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGaa > 1:1578570/1‑58 (MQ=255) aaaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGaa > 1:4528109/1‑58 (MQ=255) aaaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGaa > 1:823870/1‑58 (MQ=255) aaaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCt > 1:3215227/1‑64 (MQ=255) aaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGa < 1:4233770/71‑1 (MQ=255) aaaTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGa < 1:2165011/71‑1 (MQ=255) aaTGTAACATCTCTATGGACACTCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGa < 1:1606806/70‑1 (MQ=255) aTGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGa > 1:1608773/1‑69 (MQ=255) catctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAATAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctc > 1:3889003‑M2/6‑71 (MQ=255) catctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctc < 1:2236400‑M2/66‑1 (MQ=255) catctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctc > 1:569118‑M2/6‑71 (MQ=255) catctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctc > 1:211063‑M2/6‑71 (MQ=255) atctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctct > 1:3462593‑M2/5‑71 (MQ=255) atctCTATGGACACGAACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctct > 1:3203683‑M2/5‑71 (MQ=255) tctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCa > 1:342800‑M2/4‑42 (MQ=255) tctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCa > 1:839538‑M2/4‑42 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:164057‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:3588005‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1632544‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1409877‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:1696770‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:4633035‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:2218470‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:2757210‑M2/3‑38 (MQ=255) ctCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACaaa > 1:3171103‑M2/3‑38 (MQ=255) tCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCa > 1:2551708‑M2/2‑40 (MQ=255) tCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCa > 1:1295095‑M2/2‑40 (MQ=255) tCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGctctct > 1:3640773‑M2/2‑70 (MQ=255) ctATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGc > 1:4211022/1‑64 (MQ=255) ctATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTg > 1:471733/1‑70 (MQ=255) ctATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTg > 1:3886761/1‑70 (MQ=255) | AACTCCGATTTACATGGTTGCTGTGTTGTTAAATTGTACAAAGATGTTATAGAAACAAAATGTAACATCTCTATGGACACGCACACGGATAACAACTATGAACAAATCAGGGAAATACCTCGTCTGGACAGTGCTCTCTG > minE/384694‑384833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |