| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2578583 = | 99 (1.340) | 7 (0.100) | 3/94 | NT | 7.4% | coding (82/1398 nt) | yhjA | predicted cytochrome C peroxidase |
| ? | minE | 2578605 = | 82 (1.190) | coding (104/1398 nt) | yhjA | predicted cytochrome C peroxidase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TCACGTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTT > minE/2578514‑2578652 | tcACGTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTa > 1:2948806/1‑71 (MQ=255)tcACGTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTa > 1:2798322/1‑71 (MQ=255)ctttttcgcggagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttt < 1:1780310‑M1/1‑1 (MQ=255)ctttttcgcggagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttTa < 1:715609‑M1/2‑1 (MQ=255) tttttcgcggagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttTAc < 1:4029133‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTAc > 1:147281/1‑70 (MQ=255) gTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCAc > 1:4217776/1‑71 (MQ=255) aTTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGa > 1:1134961/1‑71 (MQ=255) ttACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGat < 1:3561603/71‑1 (MQ=255) ttACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGat < 1:2015113/71‑1 (MQ=255) ttACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGa > 1:1266932/1‑70 (MQ=255) gagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttt > 1:2378653‑M1/60‑60 (MQ=255) gagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttt > 1:2449118‑M1/60‑60 (MQ=255) gagaaagcctaaaaccttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttt > 1:1149441‑M1/60‑60 (MQ=255) cgcgATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGataata < 1:3410697/71‑1 (MQ=255) cgATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGata > 1:549402/1‑66 (MQ=255) gATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATaaa < 1:2747154/70‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACg < 1:1122867/71‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACg > 1:4610196/1‑69 (MQ=255) ggCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAg < 1:4103937/71‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAg < 1:4023304/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCAGGATAATAAACGCAGTa < 1:4729529/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGt > 1:344473/1‑70 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:3300999/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:4675826/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:366510/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:886789/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:690053/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:2028813/71‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:743542/71‑1 (MQ=255) ctggctggCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTaa < 1:49630/71‑1 (MQ=255) accttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:4468896‑M1/47‑71 (MQ=255) tggcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTa < 1:4530214/65‑1 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:3703922/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:3344357/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:2164999/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGc > 1:4274761/1‑70 (MQ=255) attattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttTa < 1:83577‑M1/2‑1 (MQ=255) tCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACg < 1:3703199/55‑1 (MQ=255) gcgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGt > 1:2161935/1‑71 (MQ=255) gcgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGt > 1:1580491/1‑71 (MQ=255) cgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt < 1:1024799/71‑1 (MQ=255) gATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:2916068/1‑70 (MQ=255) gATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:3117402/1‑70 (MQ=255) aTTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGataat < 1:1590625/45‑1 (MQ=255) aTTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa < 1:4277320/71‑1 (MQ=255) aTTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa < 1:4288308/71‑1 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:3458546/1‑68 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:659509/1‑68 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:3510479/1‑71 (MQ=255) ttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGAtaataa > 1:833465/1‑45 (MQ=255) tGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGAtaataa > 1:2760142/1‑44 (MQ=255) tGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATaaa > 1:2574187/1‑45 (MQ=255) tGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATaaa > 1:736014/1‑45 (MQ=255) tGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAgg < 1:629134/70‑1 (MQ=255) cTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCa < 1:3845660/70‑1 (MQ=255) gcagatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCa > 1:2493949‑M1/26‑44 (MQ=255) gcagatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCa > 1:2270571‑M1/26‑44 (MQ=255) gcagatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCa > 1:3083996‑M1/26‑44 (MQ=255) gcagatgcctgaacatcagcctgttTACCACGATAATAAACGCa > 1:2504224‑M1/26‑44 (MQ=255) ttAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATaaa > 1:4532992/1‑39 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTaaa > 1:861196/1‑47 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:838052/1‑48 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:2247153/1‑48 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:3040470/1‑48 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:1400814/1‑62 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:3033430/1‑62 (MQ=255) agatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCAGt < 1:313463‑M1/21‑1 (MQ=255) gggTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa > 1:3560492/1‑59 (MQ=255) ggTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:1758317/71‑1 (MQ=255) ggTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:2873608/71‑1 (MQ=255) tATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGt > 1:2446134/1‑71 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTc > 1:965851/1‑53 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTc > 1:1941701/1‑53 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTc > 1:2817418/1‑53 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTc > 1:3120429/1‑53 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCAt > 1:1311746/1‑59 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCAt > 1:2098597/1‑59 (MQ=255) aTCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACCCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGt > 1:3121161/1‑70 (MQ=255) tCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTg < 1:4108625/70‑1 (MQ=255) cTGGTTACGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCg < 1:2289879/45‑1 (MQ=255) tGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGATCAGGCATCTGCTGTCAGTCaa > 1:3871358/1‑70 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACa > 1:3387014/1‑38 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACa > 1:2018152/1‑38 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:354893/1‑45 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:921285/1‑45 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgct > 1:664003/1‑60 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAGAGGCCGATGTTAAGGCATCTGCTGTCAGTGaa < 1:1400099/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:4206449/1‑44 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGa < 1:206022/67‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGa < 1:181953/67‑1 (MQ=255) tATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:3316923/60‑1 (MQ=255) aTGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa > 1:2595347/1‑46 (MQ=255) aTGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAaataa < 1:4303769/70‑1 (MQ=255) tgtgtgGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAaataat < 1:529743/70‑1 (MQ=255) tgGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGt > 1:3737863/1‑71 (MQ=255) ggTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCAt > 1:2344073/1‑45 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg < 1:1649234/40‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg < 1:3775785/40‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGtt < 1:3043759/70‑1 (MQ=255) | TCACGTATTACCGCGATCGGCCTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTT > minE/2578514‑2578652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |