| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 299638 = | 46 (0.890) | 6 (0.130) | 4/90 | NT | 11.6% | coding (534/1782 nt) | mdlB | fused predicted multidrug transporter subunits and ATP binding components of ABC superfamily |
| ? | minE | 299664 = | 51 (1.120) | coding (560/1782 nt) | mdlB | fused predicted multidrug transporter subunits and ATP binding components of ABC superfamily | |||||
GATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCG > minE/299569‑299707 | tttcgttaaagccgtcgttgatatccgccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGc > 1:582647‑M1/70‑71 (MQ=255)tttcgttaaagccgtcgttgatatccgccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGc > 1:1664841‑M1/70‑71 (MQ=255)gATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGc < 1:331610/71‑1 (MQ=255)gATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGc < 1:1673597/71‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtg > 1:2353844/1‑71 (MQ=255) tGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtg > 1:311532/1‑71 (MQ=255) cgttaaagccgtcgttgatatccgccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGCtg > 1:3431425‑M1/67‑70 (MQ=255) gtggCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtggtgg > 1:3913958/1‑70 (MQ=255) gtggCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTggtggt < 1:3813379/71‑1 (MQ=255) gCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAAt < 1:3314580/71‑1 (MQ=255) tGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATgg > 1:2173458/1‑69 (MQ=255) tGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGt > 1:322754/1‑70 (MQ=255) cgttgatatcctccaaataggcgcgcactcgacggacaatcggcgtgctgtaacg > 1:2863496‑M1/55‑55 (MQ=255) ttCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGa < 1:542319/70‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGt < 1:197142/67‑1 (MQ=255) cAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGata > 1:3028633/1‑70 (MQ=255) gCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATAc < 1:365739/71‑1 (MQ=255) ccTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGa > 1:807433/1‑65 (MQ=255) cTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGa > 1:170213/1‑64 (MQ=255) cTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCa < 1:3100870/71‑1 (MQ=255) tCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAg > 1:2519100/1‑71 (MQ=255) cGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAg > 1:233261/1‑70 (MQ=255) gACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGc < 1:308460/70‑1 (MQ=255) gccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGt > 1:2003416‑M1/44‑71 (MQ=255) ccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGc > 1:2100377‑M1/43‑44 (MQ=255) ccaaataggcgcgcacacgacggacaatcggcgtgctgtaacGc > 1:2177292‑M1/43‑44 (MQ=255) gCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtgg > 1:3546037/1‑44 (MQ=255) gCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtgg > 1:3893499/1‑44 (MQ=255) gCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCtgg > 1:1244824/1‑44 (MQ=255) gCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTa < 1:1099350/69‑1 (MQ=255) gCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACa < 1:1132839/71‑1 (MQ=255) gAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGc < 1:3576929/71‑1 (MQ=255) aaTGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGc < 1:1357165/62‑1 (MQ=255) gCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGcc > 1:327180/1‑71 (MQ=255) gCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGc > 1:3885800/1‑70 (MQ=255) gCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGc < 1:384439/70‑1 (MQ=255) aCTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGa < 1:2674859/71‑1 (MQ=255) aCTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGa < 1:215150/71‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGAt > 1:2296672/1‑71 (MQ=255) ggtggCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTg > 1:2072835/1‑71 (MQ=255) acgacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGat > 1:677925‑M1/27‑44 (MQ=255) acgacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGat > 1:2266549‑M1/27‑44 (MQ=255) cgacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGATATACCa > 1:1808208‑M1/26‑49 (MQ=255) cgacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGATATACCa > 1:1093563‑M1/26‑49 (MQ=255) gacggacaatcggcgtgctgtaacGCTGGTGGTAATGGTGatat < 1:3806215‑M1/20‑1 (MQ=255) gCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcg < 1:2984504/71‑1 (MQ=255) cGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATg < 1:275098/35‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcgtc < 1:1973031/71‑1 (MQ=255) gATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcgtc > 1:2472014/1‑71 (MQ=255) tAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACg > 1:336000/1‑56 (MQ=255) tAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACg > 1:340747/1‑56 (MQ=255) tAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcgtcgt < 1:232064/71‑1 (MQ=255) aTGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcgtcg < 1:3647778/68‑1 (MQ=255) tGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGtgtg < 1:2958748/71‑1 (MQ=255) aTTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTgcg > 1:124782/1‑71 (MQ=255) aTTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTgc < 1:2009363/70‑1 (MQ=255) aTTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTgc < 1:3656819/70‑1 (MQ=255) tttCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGt < 1:2990606/57‑1 (MQ=255) tCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAg > 1:2392289/1‑43 (MQ=255) tCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGAGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTcc > 1:289600/1‑57 (MQ=255) cccGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTgcgcgc < 1:536026/69‑1 (MQ=255) cccGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGcc > 1:1265478/1‑70 (MQ=255) ccGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTa < 1:3682028/71‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTa < 1:1897049/71‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTa < 1:506584/71‑1 (MQ=255) tgtggtgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCgtgt < 1:2503849/59‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTAttt < 1:2465212/71‑1 (MQ=255) tggtgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTg < 1:3834765/71‑1 (MQ=255) gtgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTgg < 1:2908901/70‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGc < 1:739552/35‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCcgtcg < 1:1180143/52‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCg < 1:451997/71‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCg < 1:40652/71‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCg < 1:599389/71‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCg < 1:1438548/71‑1 (MQ=255) | GATGCTGGTGGCGATGTTCAGCCTCGACTGGCGAATGGCACTGGTGGCGATAATGATTTTCCCGGTGGTGCTGGTGGTAATGGTGATATACCAGCGTTACAGCACGCCGATTGTCCGTCGTGTGCGCGCCTATTTGGCG > minE/299569‑299707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |