| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 2051691 | 56 (1.080) | 4 (0.090) | 3/90 | NT | 6.9% | intergenic (‑13/‑229) | ygiF/htrG | predicted adenylate cyclase/predicted signal transduction protein |
| ? | minE | = 2051703 | 59 (1.290) | intergenic (‑25/‑217) | ygiF/htrG | predicted adenylate cyclase/predicted signal transduction protein | |||||
GCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTT > minE/2051621‑2051761 | gCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTAT < 1:2222767‑M1/71‑1 (MQ=255)gCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTAT > 1:3342575‑M1/1‑71 (MQ=255)gCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTAT < 1:201873‑M1/71‑1 (MQ=255) aaCGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCg > 1:3123469/1‑71 (MQ=255) tCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATg > 1:2951451/1‑71 (MQ=255) cAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGt > 1:1393855/1‑71 (MQ=255) aaCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTAt > 1:1953463/1‑68 (MQ=255) aaCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATg < 1:3359695/69‑1 (MQ=255) aaCGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGt > 1:1208554/1‑70 (MQ=255) ggCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACa < 1:2104619‑M2/71‑2 (MQ=255) cACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACata > 1:2755875‑M2/1‑68 (MQ=255) cACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACa < 1:3480895‑M2/69‑2 (MQ=255) cTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACataag > 1:2859277‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTa > 1:3839553/1‑58 (MQ=255) tgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACataagt > 1:3095686‑M2/1‑63 (MQ=255) tgATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTCACTTATgtgacataaccgataagta < 1:305573‑M1/70‑20 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATgtgacataaccgataagtaa < 1:265351‑M1/69‑21 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATc < 1:2121498/50‑1 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGAc < 1:283887/70‑1 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGAc > 1:3056779/1‑70 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGAc < 1:3374924/70‑1 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGAc < 1:2353254/70‑1 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACg < 1:1888654/71‑1 (MQ=255) aTTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACg < 1:1812900/71‑1 (MQ=255) ttAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGa > 1:3619224/1‑71 (MQ=255) ttAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGa < 1:1104323/71‑1 (MQ=255) aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTg < 1:880766/64‑1 (MQ=255) aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGa < 1:2974329/71‑1 (MQ=255) aCAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGa < 1:2408385/71‑1 (MQ=255) aTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTca < 1:2327460/53‑1 (MQ=255) aTAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAAc < 1:1233234/70‑1 (MQ=255) tAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACgg > 1:2488618/1‑71 (MQ=255) tAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACgg > 1:787881/1‑71 (MQ=255) aaCTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCg < 1:3921895/71‑1 (MQ=255) tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGtt > 1:2303196/1‑41 (MQ=255) tttAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAAc > 1:286223/1‑71 (MQ=255) aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:1524876/71‑1 (MQ=255) aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:770111/71‑1 (MQ=255) aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa > 1:1189796/1‑71 (MQ=255) aTTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa > 1:3910308/1‑71 (MQ=255) ttCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGt < 1:1864312/35‑1 (MQ=255) ttCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTa < 1:2303905/37‑1 (MQ=255) ttCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa < 1:1664541/70‑1 (MQ=255) tCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTa < 1:1859651/68‑1 (MQ=255) cGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATgtgacataaccgataagt < 1:671318‑M1/47‑19 (MQ=255) cGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATgtgacataaccgataagt < 1:1886085‑M1/47‑19 (MQ=255) gATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCg < 1:3264987/71‑1 (MQ=255) aTTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGa < 1:2809864/71‑1 (MQ=255) aTTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGa < 1:2272420/71‑1 (MQ=255) tttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACataag < 1:3498274‑M2/43‑6 (MQ=255) tttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGa > 1:3731874/1‑46 (MQ=255) ttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATc > 1:1017200/1‑71 (MQ=255) ttCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATc > 1:3264093/1‑71 (MQ=255) tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACataa < 1:826314‑M2/40‑5 (MQ=255) tCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAAc > 1:1757340/1‑59 (MQ=255) cTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttt < 1:3023212/71‑1 (MQ=255) aGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCtttttt > 1:2228677/1‑71 (MQ=255) gCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTg < 1:3209477/71‑1 (MQ=255) gCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTg < 1:2253698/71‑1 (MQ=255) ccATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGAt < 1:1022039/41‑1 (MQ=255) ccATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGaa < 1:177265/44‑1 (MQ=255) ccATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCttt < 1:3903819/66‑1 (MQ=255) cATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTc < 1:108963/71‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGt > 1:459157/1‑69 (MQ=255) ggCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGTACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTga > 1:2585678/1‑66 (MQ=255) ggCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg > 1:262105/1‑70 (MQ=255) gCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACgg > 1:762417/1‑42 (MQ=255) gCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGaa > 1:2051290/1‑46 (MQ=255) ccTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAg < 1:3008690/71‑1 (MQ=255) cTTTACTTATCTGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTa < 1:3639848/48‑1 (MQ=255) cTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAg > 1:455159/1‑67 (MQ=255) cTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGa < 1:2403375/71‑1 (MQ=255) tttACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTa < 1:122083/47‑1 (MQ=255) ttACTTATCGGTTATGTCACataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaat < 1:265351‑M2/69‑50 (MQ=255) tACTTATCGGTTATGTCACataagtgaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatca < 1:305573‑M2/70‑52 (MQ=255) tACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTaa > 1:3578174/1‑46 (MQ=255) aCTTATgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatca > 1:3095686‑M1/1‑6 (MQ=255) aCTTATCGGTTATGTCACataagtaaaggccatggctcaggaaatcg < 1:1886085‑M2/47‑30 (MQ=255) aCTTATCGGTTATGTCACataagtaaaggccatggctcaggaaatcg < 1:671318‑M2/47‑30 (MQ=255) cTTATgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatcacag > 1:2859277‑M1/1‑5 (MQ=255) cTTATgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaa < 1:3498274‑M1/43‑39 (MQ=255) cTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTa > 1:1925626/1‑71 (MQ=255) ttATgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcagga < 1:826314‑M1/40‑37 (MQ=255) ttATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAt > 1:3636482/1‑71 (MQ=255) tATgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatcacagtg > 1:2755875‑M1/1‑3 (MQ=255) aTCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt < 1:3759733/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt < 1:1825301/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt < 1:220946/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt < 1:1104019/70‑1 (MQ=255) aTCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtt < 1:2942259/70‑1 (MQ=255) tgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatcacagtgcc < 1:2104619‑M1/71‑71 (MQ=255) tgtgacataaccgataagtaaaggccatggctcaggaaatcgaattaaagtttattgttaatcacagtg < 1:3480895‑M1/69‑69 (MQ=255) tCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACtt < 1:1212005/38‑1 (MQ=255) tCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtttt > 1:557287/1‑71 (MQ=255) tCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAtttt > 1:2451741/1‑71 (MQ=255) tCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTAttt < 1:3754955/70‑1 (MQ=255) | GCAACGCCTCAACGGCACTGTGATTAACAATAAACTTTAATTCGATTTCCTGAGCCATGGCCTTTACTTATCGGTTATGTCACATAAGTGACGATGAACGGCGAACTTAATGCGATCTTTTTTGTCAGTAGATAGTATTTT > minE/2051621‑2051761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |