| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2254588 = | 75 (1.450) | 4 (0.080) | 3/96 | NT | 5.7% | coding (2450/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | minE | 2254616 = | 62 (1.270) | coding (2422/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAACC > minE/2254519‑2254658 | aGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:1077585/71‑1 (MQ=255)aGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:1893856/71‑1 (MQ=255)aGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg > 1:3302781/1‑71 (MQ=255)aGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:2889778/71‑1 (MQ=255) taccgcactgaaaactgcgaactccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggtgg < 1:3135278‑M1/3‑1 (MQ=255) gTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:3429597/70‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATgg > 1:3267649/1‑63 (MQ=255) tCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACcaca < 1:906571/71‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACcaca < 1:2788419/71‑1 (MQ=255) cgcgCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATgg > 1:1779153/1‑62 (MQ=255) gcgcAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACaa < 1:2552265/70‑1 (MQ=255) gcAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCg > 1:3247801/1‑71 (MQ=255) cGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACaa < 1:2866568/64‑1 (MQ=255) cGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCtt < 1:3340079/71‑1 (MQ=255) cGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCt > 1:977679/1‑70 (MQ=255) ggCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTc < 1:1297912/71‑1 (MQ=255) tctTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCgg < 1:3008236/70‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCAt > 1:878891/1‑47 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:2883753/48‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:1044861/48‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATg < 1:1022560/48‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTa > 1:1525708/1‑52 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTa > 1:597134/1‑52 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGt < 1:3864533/69‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGt < 1:2142251/69‑1 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTaa > 1:3174004/1‑71 (MQ=255) tttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTaa > 1:264181/1‑71 (MQ=255) ttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTaa > 1:3107471/1‑70 (MQ=255) ttAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAac > 1:474612/1‑71 (MQ=255) ccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggTGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAac < 1:294377‑M1/26‑1 (MQ=255) ccggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggTGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAac < 1:2885438‑M1/26‑1 (MQ=255) tAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTaa > 1:2282099/1‑69 (MQ=255) tAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAac > 1:3111135/1‑70 (MQ=255) ggttacctgactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggTGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAacca > 1:668376‑M1/44‑71 (MQ=255) aaCGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATggg > 1:329828/1‑47 (MQ=255) aaCGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCg > 1:2732500/1‑64 (MQ=255) aCGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAacca < 1:774562/70‑1 (MQ=255) aCGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAacca < 1:887051/70‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCAt > 1:2717735/1‑42 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCAt > 1:1964794/1‑42 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccacc < 1:3931181/71‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccacc < 1:1937311/71‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccacc < 1:645319/71‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccac > 1:1258792/1‑70 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccac > 1:2729962/1‑70 (MQ=255) cGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGGCTTCGGTAaccac > 1:1796525/1‑70 (MQ=255) gTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccac > 1:1512705/1‑69 (MQ=255) caccacCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAgg > 1:3890947/1‑71 (MQ=255) ccaccCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTc > 1:2480621/1‑71 (MQ=255) gactcgtcgtctggttgacgtggcgcaggacctggTGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAaccac > 1:3249742‑M1/36‑64 (MQ=255) caccCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCgg < 1:2715209/57‑1 (MQ=255) caccCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTcc < 1:1550636/71‑1 (MQ=255) accCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGATCCt < 1:1890449/71‑1 (MQ=255) cccTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCt > 1:3409949/1‑70 (MQ=255) cccTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCt > 1:3248385/1‑70 (MQ=255) cccTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTg > 1:609498/1‑71 (MQ=255) cTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTgcg > 1:3528287/1‑71 (MQ=255) tCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTgcgc > 1:1589814/1‑71 (MQ=255) cGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTaa > 1:462842/1‑54 (MQ=255) cGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTcc < 1:64244/65‑1 (MQ=255) cGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTgcgc > 1:1300101/1‑70 (MQ=255) cGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTgcgc > 1:3114240/1‑70 (MQ=255) cGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTgcgc > 1:961212/1‑70 (MQ=255) gATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCg > 1:2837442/1‑49 (MQ=255) gATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGcc < 1:2312145/70‑1 (MQ=255) gATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCa > 1:24296/1‑71 (MQ=255) gATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCa > 1:3557564/1‑71 (MQ=255) aTAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGt < 1:2352054/50‑1 (MQ=255) tAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACg > 1:124897/1‑71 (MQ=255) aCCGGAGTCATCATGATACCTTCATGTGTACCACAATCGTCTTCGGt < 1:3913814/47‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGt < 1:359040/47‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAac < 1:479237/50‑1 (MQ=255) ccGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTc < 1:799220/70‑1 (MQ=255) ggAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCgg < 1:2071343/43‑1 (MQ=255) gAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCg > 1:951742/1‑35 (MQ=255) gAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAAcc < 1:1501580/71‑1 (MQ=255) gAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAAcc < 1:1214687/71‑1 (MQ=255) gAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAAcc < 1:1219265/71‑1 (MQ=255) aGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTa > 1:526889/1‑43 (MQ=255) gTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCAGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAAc > 1:577049/1‑68 (MQ=255) tcatgaTGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCgg < 1:414787/39‑1 (MQ=255) tcatcaTGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCgg < 1:3105335/39‑1 (MQ=255) atcatGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAgac > 1:3334620/1‑70 (MQ=255) catGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAacc > 1:27285/1‑40 (MQ=255) catGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAgacgac > 1:1136929/1‑71 (MQ=255) atGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTa > 1:494706/1‑36 (MQ=255) aTACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAg < 1:1596216/70‑1 (MQ=255) tACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGt < 1:3919122/70‑1 (MQ=255) tACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGt > 1:1210327/1‑70 (MQ=255) aCCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAgacgac < 1:2722491/65‑1 (MQ=255) aCCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTc < 1:1436419/70‑1 (MQ=255) cTTCATTGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAgacgac < 1:2603715/63‑1 (MQ=255) cTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTc < 1:290577/68‑1 (MQ=255) cTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAgg < 1:3608877/71‑1 (MQ=255) tCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCAc > 1:3255570/1‑47 (MQ=255) tCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGt > 1:2139615/1‑70 (MQ=255) tCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGt > 1:727028/1‑70 (MQ=255) tCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGt > 1:3867098/1‑70 (MQ=255) aTGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc < 1:1928251/71‑1 (MQ=255) TGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAcc > 1:1140418‑M1/1‑71 (MQ=255) | AGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTCATCATGATACCTTCATGGGTACCACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAACC > minE/2254519‑2254658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |