| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 2903481 = | 76 (1.470) | 6 (0.130) | 3/94 | NT | 7.8% | coding (564/2139 nt) | nrdD | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase |
| ? | minE | 2903505 = | 72 (1.510) | coding (540/2139 nt) | nrdD | anaerobic ribonucleoside‑triphosphate reductase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAGTAAT > minE/2903411‑2903551 | cgatattcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctga > 1:3048062‑M1/71‑71 (MQ=255) gatattcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgaa > 1:2150786‑M1/70‑71 (MQ=255) gatattcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgaa > 1:642433‑M1/70‑71 (MQ=255) atCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTaa < 1:257643/70‑1 (MQ=255) tattcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctga < 1:2941798‑M1/1‑1 (MQ=255) tattcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctga < 1:1372686‑M1/1‑1 (MQ=255) tCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTa < 1:1354961/68‑1 (MQ=255) cTGCGCAGTTACCGCGGTTGACGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGc > 1:3356472/1‑71 (MQ=255) attcactatcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAg > 1:909639‑M1/67‑70 (MQ=255) tGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGcc > 1:3286481/1‑71 (MQ=255) cgcAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGcc < 1:3661322/69‑1 (MQ=255) gcAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAg > 1:3799431/1‑66 (MQ=255) gcAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAg > 1:396679/1‑66 (MQ=255) aGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTggg > 1:1208985/1‑71 (MQ=255) gTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTgg > 1:2810104/1‑69 (MQ=255) gTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGt < 1:3489535/71‑1 (MQ=255) atcacgatctcgattactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctga > 1:3480295‑M1/60‑60 (MQ=255) cgGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATg > 1:2894850/1‑71 (MQ=255) ggTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGc > 1:707951/1‑71 (MQ=255) ggTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGc > 1:2848798/1‑71 (MQ=255) ttGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCt > 1:1796409/1‑71 (MQ=255) tGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCAt > 1:2333964/1‑66 (MQ=255) gCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCttt > 1:2816231/1‑71 (MQ=255) ttactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCt > 1:2722664‑M1/47‑68 (MQ=255) ttactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCt > 1:436348‑M1/47‑68 (MQ=255) ttactcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCt > 1:2131695‑M1/47‑68 (MQ=255) ccGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCttt < 1:1548892/70‑1 (MQ=255) cGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCt < 1:495852/53‑1 (MQ=255) cGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCa < 1:1257905/71‑1 (MQ=255) gTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTaaa > 1:3794407/1‑47 (MQ=255) gTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAg > 1:2631767/1‑71 (MQ=255) actcaccgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCttt < 1:3255713‑M1/24‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCt > 1:1923421/1‑49 (MQ=255) gagaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGt < 1:2518277/70‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGt > 1:1267190/1‑70 (MQ=255) gagaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTc < 1:423177/71‑1 (MQ=255) agaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCg < 1:3214133/71‑1 (MQ=255) agaTCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGCGTCAGCATGCCTTTCAggag > 1:107081/1‑68 (MQ=255) cgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgaaa < 1:830030‑M1/3‑1 (MQ=255) cgttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAgg < 1:3020774‑M1/28‑1 (MQ=255) tCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCttt < 1:134948/61‑1 (MQ=255) gttcttcccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgaaa < 1:3727921‑M1/3‑1 (MQ=255) cGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATc > 1:565654/1‑70 (MQ=255) gACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGc < 1:1624706/51‑1 (MQ=255) gACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGa < 1:3935331/67‑1 (MQ=255) aCTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTc < 1:417599/59‑1 (MQ=255) aCTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTc < 1:2580407/64‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAg > 1:2399437/1‑59 (MQ=255) ttCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTc > 1:2162655/1‑62 (MQ=255) ttCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTc > 1:636073/1‑62 (MQ=255) cccgatgttcaactgcatgttgatcgacctgAAAg > 1:2308607‑M1/32‑35 (MQ=255) cggcggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAg > 1:2125777/1‑45 (MQ=255) ggcggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATg > 1:3783466/1‑69 (MQ=255) cggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGt > 1:3705995/1‑71 (MQ=255) cggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGt < 1:2294664/71‑1 (MQ=255) ggTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGtt > 1:1375783/1‑71 (MQ=255) gTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGt < 1:2654833/69‑1 (MQ=255) gTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTg < 1:1838800/71‑1 (MQ=255) ttCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCaa < 1:2777483/60‑1 (MQ=255) ttCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCaa < 1:1466573/60‑1 (MQ=255) ttCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAAc < 1:525665/61‑1 (MQ=255) ttCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTg > 1:3649257/1‑70 (MQ=255) tCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGaa > 1:408576/1‑71 (MQ=255) cAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGaa > 1:3905003/1‑70 (MQ=255) cAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGa > 1:3372449/1‑69 (MQ=255) aaTCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGt > 1:1098570/1‑65 (MQ=255) aaTCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACa < 1:3523960/71‑1 (MQ=255) aTCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCg > 1:200430/1‑51 (MQ=255) ctcGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCg > 1:3461590/1‑71 (MQ=255) ggCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTTGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGAt > 1:2752864/1‑48 (MQ=255) ggCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATc < 1:3723159/67‑1 (MQ=255) ggCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCggg < 1:2361710/70‑1 (MQ=255) ggCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCgg < 1:268700/69‑1 (MQ=255) ggCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCgg < 1:877667/69‑1 (MQ=255) gCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCggg > 1:33863/1‑69 (MQ=255) cGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGgaag < 1:1376442/71‑1 (MQ=255) cGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGgaag < 1:1423430/71‑1 (MQ=255) ttCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCttt < 1:3112110/35‑1 (MQ=255) ttCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAg < 1:2938857/54‑1 (MQ=255) ttCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAg < 1:2856776/54‑1 (MQ=255) ttCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGgaagaa < 1:2823323/71‑1 (MQ=255) tCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAAc > 1:1757458/1‑71 (MQ=255) ccATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGt < 1:1723527/71‑1 (MQ=255) cATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACAt > 1:2114691/1‑45 (MQ=255) aTTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGt > 1:1835820/1‑69 (MQ=255) aTTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGt > 1:3617012/1‑69 (MQ=255) aTTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATAAACATGCAGt > 1:2101666/1‑49 (MQ=255) ttttATAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATg < 1:2282871/44‑1 (MQ=255) ttttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:1858664/1‑71 (MQ=255) ttttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:442495/1‑71 (MQ=255) ttttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:2721192/1‑71 (MQ=255) tttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:2504542/1‑70 (MQ=255) tttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:591510/1‑70 (MQ=255) tttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAg > 1:3242689/1‑70 (MQ=255) ttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATc > 1:1522106/1‑54 (MQ=255) ttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGgaa > 1:3781008/1‑59 (MQ=255) ttAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAAc > 1:828957/1‑63 (MQ=255) AAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAg < 1:3687301‑M1/43‑1 (MQ=255) AAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAGTaa > 1:1279775‑M1/1‑70 (MQ=255) AAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAGTaa > 1:3585004‑M1/1‑70 (MQ=255) | TAATCTGCGCAGTTACCGCGGTTGCCGTAGAGATCGACTTCGGCGGTTCAATCTCGGCGTTCCCCATTTTAAAGCCCTGGGTCAGCATGCCTTTCAGGTCGATCAACATGCAGTTGAACATCGGGAAGAACGGTGAGTAAT > minE/2903411‑2903551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |